Kaedah inovatif memerangi penyakit tanaman menggunakan bakteria tanah berfaedah tempatan telah muncul daripada kerjasama antara sains dan industri.
Satu pasukan saintis dari Pusat John Innes (UK) mengasingkan dan menguji ratusan strain bakteria Pseudomonas daripada tanah yang dikumpulkan dari tapak ladang, dan kemudian menyusun genom 69 daripadanya.
Dengan membandingkan genom strain yang menghalang aktiviti patogen dengan yang tidak, pasukan itu dapat mengenal pasti mekanisme utama untuk melindungi tanaman kentang daripada bakteria berbahaya.
Kemudian, menggunakan gabungan kimia dan genetik serta satu siri eksperimen, saintis menunjukkan bahawa penghasilan molekul kecil yang dipanggil lipopeptida kitaran adalah penting dalam mengawal kudis kentang (penyakit bakteria yang menyebabkan kerosakan ketara pada tanaman kentang). Molekul-molekul kecil ini mempunyai kesan antibakteria pada bakteria penyebab kudis patogen dan membantu bakteria Pseudomonas yang bermanfaat untuk berhijrah dan menjajah akar tumbuhan.
Eksperimen juga telah menunjukkan bahawa pengairan menyebabkan perubahan ketara dalam populasi Pseudomonas yang pelbagai secara genetik di dalam tanah.
Kajian itu, yang diterbitkan dalam eLife, menawarkan kaedah di mana saintis boleh mengkaji mikrobiom hampir mana-mana kawasan bidang dan mengambil kira keadaan tanah, agrokimia dan persekitaran yang berbeza.
Menggunakan kemajuan dalam penjujukan genetik berkelajuan tinggi, saintis boleh menguji mikrobiom tanah untuk bakteria berfaedah dan menentukan molekul yang dihasilkan untuk menyekat patogen. Langkah seterusnya ialah membiak dan mengembalikan mikroorganisma berfaedah ke medan yang sama.
Aplikasi yang berpotensi untuk penambah mikrobiom termasuk menyapu koktel bakteria pada permukaan ubi sebagai semburan atau terus ke dalam tanah menggunakan pengairan titisan.